工匠

劳埃德米。工匠

电子邮件地址: 工匠@chem.wisc.edu

房间号: 
4209a
电话号码: 
608-263-2594
组关系: 
史密斯集团
职位名称: 
教授
路径: 
分析
化学生物学
物料
教育: 

A.B. 1976年,美国加州大学伯克利分校
博士1981年,斯坦福大学

W上。湖化学HUBBELL教授
化学大厅菲舍尔教授
导向器, 威斯康星州的基因组中心

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研究说明

研究史密斯组是冲着强大的新技术的发展,带动生物研究。我们目前的项目包括:

为理解基因调控工具
人类基因组测序的顺利完成和其他基因组中一个新时代 生物学研究。强烈关注现在正在识别 该打开或关闭基因,然后了解如何这样的基因调节是通过关键的生物过程,疾病或环境因素的改变,如药物的监管机制。我们正在开发新的技术,以鉴定结合特定的DNA区,因为这样的调节蛋白确定的蛋白质,在很大程度上,该基因被表达。简要地,所述技术涉及的蛋白质的DNA(1)的化学交联,(2)的染色质的片段化(围绕蛋白质包裹的DNA的长链),(3)这些片段的捕获到在特异性DNA序列一个表面方式,和(4)质谱鉴定和定量蛋白质。

阵列
在90年代初的高密度DNA阵列的出现证明了生物系统的全基因组分析的阵列概念的功率。我们的组具有无掩模阵列合成器(MAS),其允许任何感兴趣的高密度DNA阵列(高达786000个个体DNA特征),以被设计和制造过夜。我们目前从事两个励磁项目是:(1)杂交驱动被酶促从数组元素复制从RNA的基因和基因组的自组装,和(2)高密度RNA阵列的制造对于在许多应用中“ RNA世界“。

proteoform判定通过质谱
现代蛋白质组学的主导模式是“自底向上”的策略,其中感兴趣的蛋白质的混合物裂解成肽,并通过液相色谱法/质谱法(LC-MS)进行分析。而自底向上策略是强大的,广泛采用的,将蛋白质分解为肽的消化意味着信息作为对在其内该肽被发现丢失的蛋白质上下文。从相同的基因可以在其分子结构显着变化产生的蛋白质:遗传变异,剪接变体,RNA编辑,和翻译后修饰(PTMS),所有产生不同形式的蛋白质的;这些被称为“proteoforms”。存在于正在研究的系统的proteoforms的知识,这对了解系统绝对必要的,因为不同的proteoforms往往有显着不同的功能特性,以及其生产的监管途径控制的重要方面。

我们正在开发proteoform分析,其中只有两个部分信息对每个proteoform,即精确质量和含有赖氨酸残基的数量的决心足以识别它的新战略。精确质量是由未消化的蛋白混合物的标准LC-MS分析在轨道阱质谱仪来确定,并且使用最近开发的同位素标记方法,确定赖氨酸计数。一个重点扶持的概念,揭示翻译后修饰的蛋白变体的搜索战略。该战略是通过阐明数百存在于酵母细胞裂解液proteoform家庭的证明。这个简单而容易地实现新的蛋白质组策略提供存在于生物系统中proteoforms空前视图,并且将从而使可能的关键新的见解生物系统和途径的功能。

奖项和荣誉

研究员,美国科学促进会 2010
匹兹堡分析化学奖 2010
在化工仪表美国化学学会奖 2005
生物分子资源设施奖协会自动化DNA测序的发展 1997
构件,1000教师 2009